В связи с усложнением строения инфузории туфельки по сравнению с другими представителями одноклеточных, происходило также закономерное усложнение и процессов их питания и выделения. Так, например, из-за того, что основной пищей инфузорий являются бактерии, она не пропускать их через поры своей клеточной стенки, которые слишком для этого малы, и у неё развивается клеточный рот с глоткой, и фагосомой на конце.
Процессы выделения инфузории происходят через сократительную вакуоль а также через всю поверхность клетки в целом, притом — с очень большой интенсивностью. За один час клетка выделяет вышеописанным образом объем вещества, примерно равный объему самой клетки.
