Грибы могут быть одноклеточными или многоклеточными эукариотами. В составе их живой клетки можно найти от одного до сотни ядер. Клетки грибов «заточены» в клеточную стенку, содержащую хитин, белки и липиды. В составе клетки гриба, кроме цитоплазматической мембраны и ядер, входят митохондрии и вакуоли. В них содержится гликоген, липиды и жирные кислоты.
Бактерии объединены в собственный Домен Бактерии. Раньше он являлся синоним Прокариотов и собирал в своем таксоне все организмы, не имеющие ядра. Учитывая миниатюрные размеры представителей домена, затрудняющие изучение, и спор в вопросах классификации, который ведут бактериологи, для упрощения восприятия темы «бактерии» школьниками, в учебниках говорится про Царство Бактерий, такое же, как Царство Грибов, Растений и Животных.
Грибы могут быть многоклеточными и одноклеточными, бактерии являются исключительно одноклеточными организмами.
Бактерии освоили большее жизненное пространство, чем грибы.
Большинство грибов видно человеческому глазу. Бактерии, имеющие размер от 0,5 до 5 мкм, можно разглядеть лишь с микроскопа.
Грибы принципиально недвижимы, среди бактерий есть типы, обладающие жгутиками.
Грибы являются четкими гетеротрофами, бактерии используют все известные на сегодня получения жизненной энергии.
Бактерии имеют более высокий уровень выживаемости и возможности распространения по планете, чем грибы.