ДНК-связывающие белки — это белки, которые образованы с ДНК-связывающих доменов, а следовательно имеют специфическую или общую сродство к одно- или двухниточных ДНК. ДНК-связывающие белки, которые есть сайт-специфическими, в основном взаимодействуют с большой бороздкой B-ДНКа, потому что она экспонирует больше функциональных групп, которые идентифицируют пару оснований. Однако известны и к малой борозды ДНК-связывающие лиганды, такие как Нетропсин, Дистамицин, Hoechst 33258, Пентамидин, ДАФИ (4.6-диамидо-2-фенол-индол) и другие.
Рибосомная РНК (рРНК) составляет основную часть РНК цитоплазмы (80-90 %). Размеры 3000-5000 пар нуклеотидов. Вторичная структура в виде двухспиральных шпилек. р-РНК является структурным компонентом рибосом - органоиды клетки, где происходит синтез белков. Рибосомы локализованы в цитоплазме, ядрышке, митохондриях, хлоропластах. Состоят из двух субъединиц – большой и малой. Малая субчастица состоит из одной молекулы рРНК и 33 молекул белков, большая субъединица - 3 молекулы рРНК и 50 белков. Белки рибосом выполняют ферментативную и структурную функции. Функции р-РНК: 1) структурный компонент рибосом – их целостность необходима для биосинтеза белков, 2) обеспечивают правильность связывания рибосомы с м-РНК, 3) обеспечивают правильность связывания рибосомы с т-РНК
