Для инфузории туфельки характерны бесполое размножение и половой процесс. Бесполое размножение — это поперечное деление клетки надвое. Половой процесс у инфузории туфельки происходит в форме конъюгации. Вначале две особи временно соединяются ротовыми сторонами. При этом между клетками образуется цитоплазматический мостик. Затем большие бобовидные ядра, находящиеся в клетках, разрушаются. Малые ядра делятся очень сложным образом, в результате чего в каждой клетке образуется по два ядра с одинаковым набором хромосом. Одно из образовавшихся ядер остается на прежнем месте, а другое по цитоплазматическому мостику перемещается в клетку партнера. Так происходит обмен наследственной информацией. Затем в каждой инфузории туфельке «свое» и «чужое» ядра сливаются, и клетки расходятся. В теле каждой особи начинаются сложные процессы, в результате чего вновь формируются малое округлое и большое бобовидное ядра.
И амеба и инфузория туфелька имеют сократительную и пищеварительную вакуоли. Амеба обыкновенная не имеет постоянной формы тела. Она способна образовывать ложноножки, с помощью которых питается и передвигается. Дыхание и выделение происходит через всю поверхность тела. Размножение только бесполое — путем деления клетки надвое. Тело инфузории туфельки покрыто сложноустроенной оболочкой с большим количеством ресничек, имеются клеточный рот и клеточная глотка. Характерно наличие двух ядер разной формы и размеров, чего нет у амебы. Бесполое размножение — поперечное деление клетки надвое; половой процесс — конъюгация.