Из-за низкого уровня воды среднего течения, Или было зачастую трудно использовать для орошения долины, в связи с чем в период 1965—1970 годы в 12 км ниже посёлка Илийск на трассе Алма-Ата — Талды-Курган была построена плотина Капчагайской ГЭС, образовавшая Капчагайское водохранилище (в 60 км от Алма-Ата).
В настоящее время Китай строит канал от реки Или до западной части Таримской котловины. По состоянию на 2007 год Китай отбирал около ⅓ стока Или для водоснабжения Синьцзян-Уйгурского автономного района и планирует увеличивать отбор воды. Это может привести к ухудшению экологического состояния оз. Балхаш[5].
1. Несвоевременное проведение рекультивационных работ на объектах уранодобывающего комплекса, где в результате многолетней производственной деятельности был накоплен большой объем хвостов производства и забалансовых урановых руд.2. Ежегодно всё новые и новые площади земли занимаются санкционированными и несанкционированными свалками и навозохранилищами, что связано с отсутствием технологий по утилизации и уменьшению накоплений твердых бытовых отходов.3. Источником питьевого водоснабжения г.Кокшетау является Чаглинское водохранилище. Состояние водохранилища неудовлетворительное. На головном водозаборе имеются наносы ила и песка, не работают донные водовыпуски.4. На полигоне ТБО г.Кокшетау сложилась неблагополучная обстановка, не обеспечено разделение и складирование отходов по видам и их переработка.5. Не решена проблема пыления хвостохранилища ХГМЗ в г.Степногорске.6. Необходимость разработки Генерального плана развития ЩБКЗ.7. Необходимо разработать мероприятия по проектированию и очистки озер ЩБКЗ от иловых отложений.
