Ложе океана занимает самую большую часть его дна. Оно пересечено многочисленными поднятиями, отделенными друг от друга обширными зодводными котловинами. Среди подводных возвышенностей выделяется система Срединно-Индоокеанских хребтов, три ветви которых расходятся из района острова Родригес. На северо-запад отходит Аравийско-Индайский хребет, на юго-запад — Западно-Индийский хребет, переходящий далее в Африкано-Антарктический, на юго-востоке — Центральный, который затем продолжается Австрало-Антарктическим поднятием. В восточной части океана почти по меридиану вытянут Восточно-Индийский хребет. На юге от острова Кергелен к Антарктиде подходит хребет Кергелен. В разных районах океана прослеживается много небольших поднятий. Крупные и менее значительные подводные возвышения разделяют океаническое ложе на различные по размерам и глубинам котловины. К ним относятся: Оманская, Аравийская, Сомалийская, Коморская, Маскаренская, Мадагаскарская, Крозе, Западно- и Южно-Австралийская и др. К краевому глубоководному Зондскому желобу приурочена максимальная глубина Индийского океана (7130 м). Главные особенности рельефа океанского дна выявлены в основном в последние 10-15 лет.
Значение подземных вод очень велико, их можно отнести к числу полезных ископаемых наряду с углём, нефтью или железной рудой. Подземные воды питают реки и озёра, благодаря им реки не мелеют летом, когда выпадает мало дождей, и не пересыхают подо льдом. Человек широко использует подземные воды: их выкачивают из-под земли для водоснабжения жителей городов и деревень, для нужд промышленности и для орошения сельскохозяйственных угодий. Несмотря на огромные запасы, подземные воды возобновляются медленно, существует опасность их истощения и загрязнения бытовыми и промышленными стоками. Чрезмерный забор воды из глубинных горизонтов уменьшает питание рек в межень — период, когда уровень воды самый низкий.
