Интенсивное использование агрохимикатов, отвод огромного количества поливной воды из двух рек, которые питают регион, и хроническое отсутствие водоочистных сооружений являются одними из факторов, которые вызвали огромные проблемы со здоровьем и окружающей средой. Опустошение окружающей среды в Узбекистане лучше всего иллюстрируется катастрофой Аральского моря. Из-за утечки Амударьи и Сырдарьи для выращивания хлопка и других целей то, что когда-то было четвертым по величине внутренним морем в мире, сократилось за последние тридцать лет до примерно одной трети его объема 1960 года и менее половины его географического размера 1960 года.
Высыхание и засоление озера вызвали сильные штормы соли и пыли с высушенного морского дна, нанося ущерб сельскому хозяйству и экосистемам региона и здоровью населения. Опустынивание привело к крупномасштабной гибели растений и животных, потере пахотных земель, изменению климатических условий, истощению урожаев на обрабатываемых землях, которые остаются, и уничтожение исторических и культурных памятников. По сообщениям, каждый год многие тонны соли перевозятся на расстояние до 800 километров
