В археологической науке Казахстана эпоха мезолита изучена недостаточно. Только в результате археологических исследований в районе Есиля, в Кустанайской области и близ Тургая были найдены некоторые памятники мезолита. Период перехода от раннего палеолита к среднему палеолиту совпал с таянием ледников. В природноклиматических условиях произошли существенные изменения, многие виды гигантских животных вымерли, большие изменения претерпел и мир растений. Изменение фауны и другие факторы обусловили возникновение земледелия и новых элементов животноводства, а в некоторых регионах сложились новые формы рыболовства и охоты. Существуют различные мнения относительно хронологии и характеристики мезолита. Однако исследователи этого периода Ж.К Таймагамбетов, В.И. Логвин и А.М. Кисленко, основываясь на результатах археологических исследований, предлагают признать хронологические границы среднекаменного века, относящиеся к 10-5 тысячелетиям до н.э. Неолит (5 – 3 тыс. до н.э.) В этом периоде человечество достигло высокого уровня в технике обработки камня. Произошла большая специализация в производстве орудий труда. Наряду с совершенствованием техники отжимной ретуши появились новые технологические приемы обработки камня: шлифование, сверление, пиление, использовались все труднообрабатываемые породы камня, изготавливались каменные топоры, мотыги, зернотерки, ступки, песты. Другим достижением людей эпохи неолита было изготовление различной посуды из глины. Все это и возникновение земледелия и скотоводства повышению производительности труда и жизненного уровня первобытных людей. Теперь охота и собирательство превратились в дополнительные источники существования. Возникновение новых отраслей хозяйственной жизни, усовершенствование техники изготовления орудий труда, повышение производительности труда появлению зачатков ткачества и горнометаллургического дела. Люди эпохи неолита жили в условиях родовой общины. Они вели коллективный образ жизни, трудились сообща. Вместе с тем это было время более высокого развития форм организации общества: образования племён и племенных объединений. Племена состояли из нескольких родовых общин, объединённых кровнородственными узами и однородным характером хозяйства.
В начале XVIII в. международные отношения в Центральной Азии обостряли агрессивные действия Джунгарского ханства. Наиболее значительное влияние на международные отношения в Центральной Азии в этот период оказывало джунгаро-казахское противоборство.
Наибольшая угроза для казахов в первой половине XVIII в. нависла со стороны Джунгарского ханства. Основная цель нашествий джунгарских правителей на территорию Казахского ханства заключалась в подчинении казахских степей своей власти, в захвате кочевий и пастбищ. В выгодное положение, по отношению к казахскому ополчению, джунгар ставило наличие у них артиллерии. Для войны с казахами джунгары покупали вооружение и пушки у русских оружейников.
В конце XVII - начале XVIII вв. хан Тауке направил главные усилия страны на отражение ойратских набегов, восстановил государственность и сохранил территориальную целостность Казахского ханства. В первой четверти XVIII в. к объединению трех жузов казахов побудили вторжения джунгар. Летом 1710 г. с целью создания единого ополчения против джунгар, в районе Каракумов состоялся первый курултай трех казахских жузов. По решению курултая единое ополчение казахов против джунгар возглавил Богенбай батыр.
После смерти Тауке хана, из-за обособления трех жузов, внутреннее положение в Казахском ханстве становилось напряженным и противоречивым. Используя несогласованные действия казахов и свое военное превосходство, джунгарские войска в 1711-1717 гг. оккупировали часть Жетысу. В 1718 году близ Аягуза в трехдневном сражении с джунгарами из-за того, что казахские султаны действовали разрозненно, казахские ополчения потерпели поражение.
1723 - 1727 гг. вошли в историю казахского народа как Годы Великого бедствия, в этот период особенно пострадала территория Жетысу. Основной причиной трагедии 1723-1727 гг. является отсутствие в казахском обществе политического единства. В 1724-25 гг. джунгарами были захвачены в города Туркестан и Ташкент.
В организации освободительной борьбы казахских жузов против ойратской агрессии, важную роль сыграл хан Абулхаир. На него было возложено общее командование объединенными силами трех казахских жузов. В районе горы Ордабасы и в последующих сражениях, казахское войско было организовано и рассредоточено по принципу принадлежности к жузам. Первая крупная победа казахского народа в борьбе с джунгарами была одержана у р. Буланты в 1726 г. Место сражения и победы казахского ополчения над джунгарами в 1726 г. в народной памяти сохранилась под названием Калмак кырылган. Выдающуюся роль в объединении казахских родов для освободительной войны с джунгарами сыграли Толе-бий, Казыбек-бий, Айтеке-бий.
Самое крупное сражение между казахским ополчением и джунгарами в местности Анракай в 1730 г. закончилось разгромом джунгарских войск, главной причиной победы казахов над джунгарами в этом сражении является выступление казахских жузов единым фронтом. Но разногласия среди султанов стали причиной того, что казахи не воспользовались благоприятной ситуацией и результатами победы в Анракайском сражении.
В 30-40-х годах XVIII в. угроза над казахами нависла со стороны иранского правителя Надир шаха захватившего южные районы Казахстана. По своим последствиям не менее тяжелым, чем Годы Великого бедствия, оказалось нашествие на Средний и Старший жузы Галдан-Цэрэна в 1741 -1742 гг.
Агрессивная политика Джунгарского ханства представляла собой реальную угрозу не только для казахов, но и для России. Защищая свои экономические интересы, Россия в 1742 г. потребовала от джунгарских правителей прекращения агрессии. На дипломатические протесты России в 1742 г. о недопустимости вмешательства джунгар в дела казахов Галдан-Цэрэн не только не реагировал, но и требовал уничтожения русских крепостей в Верхнем Прииртышье.
В 40-е годы XVIII в. Россия для защиты своих экономических интересов от джунгар возводила новые крепости и форпосты в Верхнем Прииртышье. Казахи не препятствовали их строительству, полагая, что крепости станут опорой в борьбе с джунгарами, и они сыграли заметную роль в защите казахов в период джунгарской агрессии в первой половине XVIII в. Главной силой противодействия джунгарской агрессией оставалась освободительная борьба народа.
Реальная угроза порабощения джунгарами казахских земель была устранена со смертью в 1745 г. правителя Галдан-Цэрэна. После смерти Галдан-Церена в 1745 г. начинается борьба за престол между наследниками, что привело Джунгарское государство к упадку. Ослабил военное могущество Джунгарии и Аблай, опираясь в основном на народных батыров. Ослаблением Джунгарии воспользовался Китай. В 1756-1758 гг. Джунгария была окончательно разгромлена маньчжуро-цинскими войсками (Китаем) и прекратила свое существование как государство, в 1761 г. была превращена в Цинское имперское наместничество - Синьцзян