Беспощадно. Важно помнить, что борьба с еретиками, это не столько религиозная, сколько политическая деятельность. В период, когда церковь беспщадно казнила, пытала, преследовала еретиков, это была не прихоть, а необходимость (при этом я не оправдываю такие действия и не одобряю их). Церковь была важным государственным институтом, её политическая и экономическая власть была крайне велика. Борьба с еретиками это прежде всего борьба с политически неуголными элементами и демонстрация своих возможностей для устрашения остального насления. У любой "охоты на ведьм" всегда найдётся политическая или экономическая подоплёка.
В результате русской крестьянской колонизации были освоены новые районы: на юге страны, в Поволжье, Башкирии, Сибири. Во всех этих местах возникли новые очаги земледельческой культуры. Но общий уровень развития сельского хозяйства оставался низким. Быстро росло дворянское землевладение в результате многочисленных правительством поместий и вотчин дворянам. К концу XVII века вотчинное дворянское землевладение стало превышать доминирующее ранее поместное землевладение.