Флаг разработан на основе герба города, который языком символов показывает природные, исторические и культурные особенности города.
Благодарный был основан во второй половине XVIII столетия выходцами из южных губерний России. Первоначально поселение располагалось на одном берегу реки Буйвола, но со временем разрослось и раскинулось уже на обоих берегах. Старинный мост соединяет две части одного целого, а голубой цвет щита показывает реку Буйволу давшую жизнь степному городу. Мост также символизирует связь и настоящего, сохранение традиций и преемственность поколений жителей города.
Одной из главных достопримечательностей города, отражённых в гербе является уникальный вид голубей, который был выведен в Благодарном. Птицы с бело-красным оперением являются гордостью местных жителей и известны во всём мире. Существует легенда о появлении Благодарненской породы голубей. Во время русско-турецкой войны казаки из Благодарного штурмом взяли неприятельскую крепость. Отдыхая после боя они обратили внимание на местных голубей красно-коричневого цвета. Уже тогда среди благодарненцев было много голубятников, но голубей они водили только белых. Возвращаясь на родину бойцы захватили "пернатых турок" и с тех пор будто бы и пошла благодарненская порода красно-белых голубей. Голубь - традиционный символ мира, духовности, вдохновения.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, взаимопонимания.
Жёлтый цвет (золото) - символ богатства, стабильности, уважения и интеллекта.
Голубой цвет - символ чести, славы, верности и искренности.
Красный цвет - символ мужества, силы, труда и красоты.
Утвержден решением Благодарненской городской Думы
от 02.03.2006 № 283
На самом деле этот памятник на Сенатской площади Санкт-Петербурга вовсе не медный, а бронзовый. Второе, более популярное название, пристало к нему позднее, после поэмы А. С. Пушкина «Медный всадник». Автор проекта, французский скульптор Этьен-Морис Фальконе, в свое время отстоял натиск всех противников своей идеи, включая императрицу Екатерину II. Из-за разногласий и сложностей в отливке, беспрецедентному для тех времен предприятию, работа над памятником продолжалась целых 16 лет. В итоге конная статуя первого российского императора, стоящая на огромной глыбе гранита, была торжественно установлена 7 августа 1782 г. (по старому стилю). Сегодня, как и двести с лишним лет назад, «Медный всадник» является одним из главных символов Северной столицы.
Правая рука Петра направлена в сторону Швеции. В Стокгольме же стоит памятник его противнику в Северной войне - Карлу XII, указывающему рукой в сторону России.