Флаг разработан на основе герба города, который языком символов показывает природные, исторические и культурные особенности города.
Благодарный был основан во второй половине XVIII столетия выходцами из южных губерний России. Первоначально поселение располагалось на одном берегу реки Буйвола, но со временем разрослось и раскинулось уже на обоих берегах. Старинный мост соединяет две части одного целого, а голубой цвет щита показывает реку Буйволу давшую жизнь степному городу. Мост также символизирует связь и настоящего, сохранение традиций и преемственность поколений жителей города.
Одной из главных достопримечательностей города, отражённых в гербе является уникальный вид голубей, который был выведен в Благодарном. Птицы с бело-красным оперением являются гордостью местных жителей и известны во всём мире. Существует легенда о появлении Благодарненской породы голубей. Во время русско-турецкой войны казаки из Благодарного штурмом взяли неприятельскую крепость. Отдыхая после боя они обратили внимание на местных голубей красно-коричневого цвета. Уже тогда среди благодарненцев было много голубятников, но голубей они водили только белых. Возвращаясь на родину бойцы захватили "пернатых турок" и с тех пор будто бы и пошла благодарненская порода красно-белых голубей. Голубь - традиционный символ мира, духовности, вдохновения.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, взаимопонимания.
Жёлтый цвет (золото) - символ богатства, стабильности, уважения и интеллекта.
Голубой цвет - символ чести, славы, верности и искренности.
Красный цвет - символ мужества, силы, труда и красоты.
Утвержден решением Благодарненской городской Думы
от 02.03.2006 № 283
Лариса Латынина до сих пор считается сильнейшим олимпийцем XX века, так как на Олимпийских играх она выиграла рекордное число медалей. Родилась Латынина (в девичестве Дирий) на Украине, в городе Херсоне, в 1934 году, 27 декабря. В детстве Лариса занималась танцами, затем увлеклась гимнасткой. В 16 лет она выполнила нормативы и получила звание мастера спорта. Девушка прекрасно училась, по окончании школы ей вручили золотую медаль. А первую спортивную золотую медаль она получила на чемпионате мира в 1954-м. В 1956 и 1960 годах Латынина становится абсолютной олимпийской чемпионкой. Получила спортсменка медали в различных дисциплинах и на инсбрукской Олимпиаде, проходившей в 1964 году. Знаменитые спортсмены России, в том числе и Лариса Латынина, успешно участвовали в европейских, мировых чемпионатах. Великая гимнастка – многократная победительница соревнований такого рода, имеет титул заслуженного мастера спорта. В 1957 году, на Чемпионате мира, поднялась на первую ступень пьедестала по результатам всех гимнастических дисциплин. У нее 4 бронзовые, 5 серебряных и девять золотых медалей.