Итак, приступим.
Впрочем,(1) за исключением матери,(2) Мушку ненавидили все:(3) и домашние,(4) и посторонние - он это знал,(5) и отвечал тем же чувством всему миру:(6) и живым существам,(7) включая кошку,(8) и неодушевлённым предметам,(9) исключая съебное.
Итак, 1, 2, 7, 8 и 9 запятые - это все у нас обособленные дополнеия.
Падежные формы имен существительных с предлогами кроме, вместо, помимо, включая, за исключением, исключая и т.д. могут обособляться запятыми, в зависимости от смысловой нагрузки, желания автора подчеркнуть их роль в предложении.
3 и 6 двоеточия - здесь идет перечисление, поэтому, думаю, не нуждается в доп комментариях.
4 и 5 разделяют однородные члены (4(и домашние, и посторонние)(5(и знал, и отвечал))
герои книги-не только люди - выделительная частица