Это, действительно, непростое слово.
Объяснение:
Для начала нам нужно определиться с частью речи, а потом задаваться вопросом в течениЕ или в течениИ.
Если в течениЕ, то это производный предлог, который употрябляется только с существительными в Р.п.,имеющими временное значение т.е. в течение секунды, часа, дня, ночи и т. д.
В предложении при желании можно заменить синонимами: на протяжении, в период, за время и др.
Если же это существительное с предлогом, то в течениИ, то слово имеет значение «направление движения воды», ставится в форме П.п. (в чём?) – в течении реки.
