Необхідно підкреслити , що , незважаючи на протилежну спрямованість двох центральних процесів рослинного організму - фотосинтезу і дихання і на їх локалізацію в різних органелах клітини , між ними існує тісний взаємозв'язок. Перш за все, для протікання процесу дихання потрібні органічні речовини ( субстрати ) . Такими субстратами в першу чергу є вуглеводи , які у зелених рослин утворюються в процесі фотосинтезу. Разом з тим перетворення речовин в процесі фотосинтезу і дихання йде через ряд схожих проміжних продуктів.
Усі найпростіші належать до еукаріот, їхні клітини мають оформлене ядро, в якому міститься генетичний матеріал. Від навколишнього середовища клітина відмежована клітинною мембраною, яка виконує бар’єрну та захисну функції. У цитоплазмі розрізняють два шари: ектоплазму (зовнішній) і ендоплазму (внутрішній). До органел, типових для еукаріотичних клітин, належать мітохондрії, ендоплазматичний ретикулум, рибосоми, апарат Гольджі, лізосоми, ядро. Поряд із ними в цитоплазмі найпростіших присутні специфічні органели — травні та скоротливі вакуолі, базальне тільце (у джгутикових), вічка.