Для классификации папоротников в разное время были предложены многочисленные схемы, и они зачастую плохо согласовывались друг с другом. Современные исследования поддерживают более ранние идеи, основанные на морфологических данных. В то же время, в 2006 году Аланом Смитом (англ. Alan R. Smith), ботаником-исследователем Калифорнийского университета в Беркли, и другими была предложена новая классификация, основанная, в дополнение к морфологическим данным, на недавних молекулярных систематических исследованиях. Эта схема делит папоротники на четыре класса: Psilotopsida Equisetopsida Marattiopsida Polypodiopsida Последняя группа включает большинство растений, известных нам как папоротники.
Корень может представлять собой 3 типа частей- главный,придаточный и боковой(см.приложение 1). Принято различать два распространенных типа корневой системы: Стержневой и Мочковатый(см.приложение 2). Стержневая корневая система характерна для двудольных(но есть свои исключения,приведу в пример Большой подорожник-у него мочковатая корневая система).Особенностью корневой системы является- мощный,хорошо развитый Главный корень.Образована такая система главным и боковыми корнями. Представители стержневой системы: клен,цикорий,свекла,морковь,одуванчик. А Мочковатая корневая система характерна для однодольных.Это система образована боковыми и придаточными корнями,а вот главный корень или плохо развит или совсем отсутствует. Представители мочковатой системы:овес,ячмень,тюльпан,чеснок,кукуруза.