Недостаток бесполого размножения в том, что источником необходимого для естественного отбоpa разнообразия (изменчивости) являются только мутации. Поэтому, если две благоприятные мутации а → А и в → В, возникают у разных особей бесполой популяции, то посредством которого обе эти мутации могли бы оказаться в генотипе одного из потомков этих особей не существует. Особь с генотипом АВ может появиться лишь в том случае, если вторая мутация В произойдет у одного из потомков исходного мутанта А, или наоборот, если мутация А возникнет у потомка мутанта В
Ещё одним недостатком бесполого размножения является отсутствие механизма, препятствующего накоплению вредных мутаций. Бесполая популяция непрерывно ухудшается и не имеет никакого возвратиться к начальному состоянию без мутаций, подобно трещотке, которая может вращаться только в одном направлении (“Гипотеза Трещотки”). Увеличение размера генома приводит к возрастанию количества мутаций, поэтому у бесполых организмов геном не может расти выше определенного предела. Половая рекомбинация может устранять мутации, за счет перекреста между хромосомами (кроссинговера) и таким образом снимает ограничение на рост величины генома. “Гипотеза Трещотки” может объяснить, почему бесполые популяции вымирают чаще чем половые, однако она не объясняет, почему бесполые особи периодически не возникают и не распространяются в половых популяциях.
Половое размножение ограничено той частью года, когда условия наименее предсказуемы. Локализация бесполых потомков около родителей связана с их более крупными размерами и малой подвижностью. У растений семена относительно малы, имеют специальные при для широкого распространения. Одно растение может дать семена с разными латентными временами от месяца до многих лет, и такие семена отличаются на вид. Высокая смертность связана, видимо, как с размерами (крупные семена лучше обеспечены ресурсами), так и латентным периодом и пространственно широким распределением.
