У хрящевых рыб мощный плечевой пояс дает возможность передвигаться с высокой скоростью. Начало аорты и желудочек усиливают кровоток. Сложные органы размножения и внутреннее оплодотворение гарантируют высокую выживаемость потомства.
У костных рыб чешуя из тонких пластин является более надежной защитой. Костный скелет является более прочным в сравнении с хрящевым. Устройство жабр и наличие жаберных крышек помогают увеличить приток кислорода в организм. Плавательный пузырь помогает рыбам опускать и подниматься в толще воды, не выполняя при этом никаких движений. Костные рыбы не обязаны постоянно находиться в движении в отличие от хрящевых.
Рыбы являются прямыми потомками низших беспозвоночных. Естественный отбор благоприятствовал затвердеванию чехла вокруг хорды. Позвоночник, сохранив гибкость, придал скелету такую жёсткость, что усилие мышц стало возможно увеличить и в 100 раз. Предшественниками настоящих рыб были бесчелюстные позвоночные. Вместо челюстей их рот окружён мускулистой воронкой, а череп состоит из хрящей. В начале палеозоя все эти экологические ниши занимали беспозвоночные и бесчелюстные. Только ниша крупного, свободно плавающего хищника оставалась свободной. Поэтому крупные животные, способные найти, догнать и схватить, сразу получили бы эволюционное преимущество. Но подходящих кандидатов не было. Не было до тех пор, пока не появились животные с позвоночником, достаточно прочным, чтобы превзойти по размерам таких монстров, как ракоскорпионы и кальмары. Так появились настоящие рыбы – сначала с хрящевым, а потом и с костным скелетом.