С целью дальнейшего распространения исламской религии в конце IX века династия Саманидов объявила «священную войну» карлукам и захватила Испиджаб. Правитель города покорился власти Саманидов и обязался платить подати. Саманиды подчинили себе и город Тараз, где была построена мечеть. Тараз оказался в вассальной полузависимости от этой династии. Каган Огулшак, являвшийся в то время правителем города, был вынужден временно перебраться в Кашгар. Большинство представителей знати Карлукского каганата жили во второй столице - городе Баласагун.
Несмотря на религиозное господство Саманидов в Испиджабе и Таразе, власть здесь фактически находилась в руках карлуков. Поэтому борьба против Саманидов никогда не прекращалась. Руководили борьбой сыновья кагана Бильге Кул Кадыр-хана - Ба-лар Арслан и Огулшак.
В общей сложности сопротивление карлуков арабам продолжалось около двух веков. Этот период можно разделить на два этапа: первый - с 712-713 годов борьба велась в союзе с жителями Согдианы, Шаша и Ферганы. Она длилась до 766 года, когда карлуки захватили власть в свои руки. Следующий этап охватывает период времени со второй половины VIII века до конца IX века. Карлуки в этот период часто терпели поражения от арабов. Это можно объяснить тем, что арабы умело использовали исламскую религию как идейное оружие. Ослабляли Карлукский каганат и внутренние междоусобицы. Воспользовавшись тяжелым положением в Карлукском каганате, тюркские правители Кашгарии в 940 году захватили город Баласагун и каганат был разгромлен. Через дна года город захватил сын Арслан-хана Сатук Богра-хан. В периоды правления этого хана и его сына произошло массовое принятие карлуками исламской религии. Богра-хан является основа- телем государства Караханидов.
Таким образом существовавший около двухсот лет Карлукский каганат распался.
сенат - орган управления, республика - власть народа