Методы иселедования наследственности очень разнообразны.Среди современных методов генетического анализа можно назвать цитогенетические метод, заключающий в изучении хромосом объекта при микроскопа и позволяющий определить их число и форму, а также биохимический метод и др. Г. Мендель в своей работе использовал гибридологический метод, который стал основой его опытов, Применение учёным математических методов позволило ему сделать на основе частных опытов важнейшие выводы, которые оказались справедливы для всех живых существ на Земле и заложили основу новой науки генетики.
Суть гибридологического метода заключается в скрещивании специально подобранных пар организмов и тщательном изучении полученных потомков. Скрещивание организмов, отличающихся друг от друга одним или несколькими признаками, называют гибридизацией, а потомков от такого скрещивания - гибридами, Поэтому и метод получил название гибридологического. Этот метод до сих пор лежит в основе генетических исследований.
Генотип и условия окружающей среды влияют на формирование фенотипа. Фенотипические признаки, определяемые теми или иными генами, в различных условиях существования развиваются по-разному. К сожалению, по фенотипу не всегда можно понять, какие гены содержит данная особь, поэтому необходимо проведение соответствующих исследований.
Проводя опыты, Г. Мендель работал с горохом. Он использовал для скрещивания растения, которые относились к определённым сортам. Так, имеются сорта с белыми и красными цветками, желтыми и зелёными, гладкими и морщинистыми семенами и т. п.
Такие сорта называют чистыми линиями. Горох легко выращивать, в условиях Чехии он даёт несколько урожаев в год. Горох-самоопыляемое растение, поэтому в природных условиях сорта обычно не смешиваются. В эксперименте самоопыление легко предотвратить, и экспериментатор может опылять растение пыльцой с другого растения, т. е, перекрёстно.