Лишайники являются индикаторами загрязненности воздуха вредными веществами. Они не могут жить в местах где воздух сильно загрязнен вредными газами. Участвуют в общем круговороте веществ в биосфере. Благодаря фотосинтезу синтезируют органические вещества в местах недоступных для других организмов. Участвуют в почвообразовании, т.к. разрушают горные породы, на которых поселяются, а за счет разложения слоевища образуется гумус. Таким образом, лишайники создают условия для существования растений и животных. Кормовые лишайники играют важную роль в хозяйстве. Например, олений мох или ягель поедается оленями, косулями, лосями и другими животными. Некоторые виды лишайников используются в пищу человеком (лишайниковая манна). Так же лишайники используются в парфюмерии для получения ароматических веществ, в фармацевтической промышленности для получения препаратов против туберкулеза, фурункулеза, эпилепсий и др. А лишайниковые кислоты обладают также антибиотическими свойствами.
К весьма ценным лекарственным растениям относятся сфагновые мхи, содержащие бактерицидные вещества (например, сфагнол). В Республике Коми известно 33 вида из рода Sphagnum. Наиболее удобными для медицинских целей оказались сфагновые мхи из секции Palustria, которые в высушенном состоянии менее крошатся и обладают большой сорбционной Это такие широко распространенные виды, как Sphagnum magellanicum и Sphagnum centrale. Однослойные листья сфагнов состоят из узких живых клеток, содержащих плазму и хлоропласты и образующих своеобразную сетку, петли которой заполнены широкими бесцветными клетками, лишенными содержимого. Благодаря такому строению листьев, сфагновые мхи всасывать и сравнительно долго удерживать значительное количество воды (в 10 раз больше своей массы). На этом основано применение сфагновых мхов в качестве перевязочного материала, обладающего к тому же бактерицидными свойствами. Стерилизованные марлевые подушечки, наполненные сухим сфагнумом, используют для быстрого и успешного заживления гнойных ран. Бактерицидные вещества этих мхов термостабильны и не разрушаются при стерилизации. Заготавливать сфагнум можно на верховых и переходных болотах. Еще в 80-е годы столетия сфагновые мхи собирали в Великобритании для изготовления стерильного перевязочного материала для нужд хирургии. Имеются сведения об изготовлении жителями Аляски лечебной мази из сфагнума, смешанного с животным жиром.