Позвоночник содержит только 9 позвонков и, в отличие от позвоночника рыб, имеет 4 отдела: шейный, туловищный, крестцовый и хвостовой. Туловищные позвонки имеют спереди вогнутую, а сзади выпуклую поверхности, т. е. относятся к типу процельных. Все они снабжены верхними дугами, ограничивающими спинномозговой канал, и заканчиваются остистыми отростками. С боков от позвонков отходят большие поперечные отростки, а спереди и сзади у основания верхних дуг лежит по паре коротких сочленовных отростков, служащих для соединения с соответствующими отростками соседних позвонков. Ребер нет.
Характерная черта скелета — отсутствие костей: он состоит из одного хряща, который, однако, может пропитываться известью и приобретать значительную твердость.
Скелет состоит из основных отделов:
1) осевой скелет, 2) череп, 3) скелет конечностей.
Осевой скелет состоит из позвоночника, или позвоночного столба (columna vertebralis), образованного многочисленными подвижно сочлененными друг с другом позвонками (vertebra). Основную часть позвонка составляет его тело, которое имеет глубокое вдавление как спереди, так и сзади — такие позвонки называются двояковогнутыми, или амфицельными. Они чрезвычайно характерны для рыб. Тело каждого позвонка в центре имеет отверстие, через которое проходит хорда. Таким образом, хорда пронизывает весь позвоночник, расширяясь между смежными позвонками и суживаясь при прохождении через каждый позвонок, т. е. имеет характерную для рыб четкообразную форму. Сверху от тел позвонков отходят парные выросты —верхние дуги, между которыми располагаются верхние вставочные пластинки. Верхние дуги вместе с вставочными пластинками окаймляют боков спинномозговой канал. Снизу от тел позвонков отходят парные нижние дуги. В туловищном отделе нижние дуги представлены короткими боковыми отростками, к которым причленяются ребра (costa), оканчивающиеся свободно и ограничивающие полость тела только сверху. В хвостовом отделе короткие нижние дуги замыкаются попарно при нижних замыкающих пластинок, образуя гемальный канал.