1) Малощетинковые черви имеют менее выраженное сегментированное строение, а многощетинковые внешне более сегментированны за счёт отходящих от каждого сегмента тела хитиновых придатков, называемых хетами.
2) Малощетинковые черви чаще встречаются в почвенной среде, а многощетинковые чаще обитатели морей.
3) У многощетинковых червей, в отличии от малощетинковых, имеются глаза.
4) Многощетинковые дышат при жабр или венчика щупалец, а малощетинковые дышат всей поверхностью тела.
5) Венчик щупалец, расположенный на голове многощетинковых также выполняет функцию конечности, которой те добывают себе пищу. Малощетинковые же пропускают через пищеварительную систему все, что попадается им на их пути.
6) Многощетинковые, в большинстве своем - раздельнополые организмы, а малощетинковые - гермафродиты.
7) Многощетинковые не имеют централизованной кровеносной системы, а малощетинковые - имеют сердце и крупные сосуды.
8) Многощетинковые к бесполому размножению, а малощетинковые - нет.
9) Среди многощетинковых достаточно часто встречается хищничество, а малощетинковые питаються в основном детритом и органическими остатками.
10) Малощетинковые имеют хорошо развитый нюх, а многощетинковые практически полностью лишены нюхового анализатора.
