Орден иезуитов был создан как своеобразная "разведка" Католической церкви: его члены могли вести мирской образ жизни, тайно существуя в любом обществе и выполняя приказы своего начальства. Целью ордена было распространение католической веры и борьба с её противниками. Деятельность Ордена привела к массовому распространению католичества в Новом Свете; другие достижения ордена не были столь известны по причине их скрытной натуры. Помимо своих тайных операций, иезуиты также вели благотворительную деятельность развитию образования и медицины в различных странах. Шпионские операции иезуитов привели к тому, что многие государства Европы начали бороться с ними, защищая свою государственную безопасность, и в 1773 году под влиянием трёх королей - французского, испанского и португальского - папа римский распустил орден. Однако иезуиты сохранились в Пруссии и России, где местные монархи не возражали против их деятельности, и долгое время существовали на неофициальном положении; именно они послужили костяком восстановленного ордена после того, как в 1814 году он был возрожден.
Своеобразной коллегией стал Синод, или Духовная коллегия, учрежденный в 1721 г. Уничтожение патриаршества отражало стремление Петра I ликвидировать немыслимую при самодержавии петровского времени “княжескую” систему церковной власти. Объявив себя фактически главой церкви, Петр уничтожил ее автономию. Более того, он широко использовал институты церкви для проведения своей политики.
Наблюдение за деятельностью Синода поручалось специальному государственному чиновнику — оберпрокурору.