В 1479 году Иван III, узнав о готовящейся измене новгородских бояр, быстро в четвертый раз подступил к Новгороду. В село Бронницу к Ивану III стали прибывать многие жители Новгорода, и заговорщики вынуждены были открыть ворота в город. Все участники заговора были подвергнуты пыткам, многие казнены, а другие высланы в поволжские города и селения. Летописец сообщал, что в 1479 году из Новгорода было вывезено 250 семей бояр и купцов, в 1480 году — 50 семей, а в 1488 году — 7 тысяч человек. Земли и усадьбы опальных бояр раздавались сторонникам московского князя, переселенным из подмосковных городов.
Купцы и бояре-переселенцы из-под Москвы стали главенствовать в Новгородском крае и скоро полностью подчинили себе город. Они получали огромные доходы от торговли и эксплуатации крепостных крестьян. Особо выделялись своим богатством несколько купеческих семей — Саларевы, Корюковы, Боровитиновы, Сырковы и Таракановы. Для своих дворов они заняли большие площади на Торговой стороне. Купцы Сырковы завладели бывшим княжеским двором на Ярославовом дворище.
После присоединения Новгорода к Москве и перераспределения земельных владений была проведена полная перепись крестьянского населения, поместий дворян и бояр. Перепись производилась по пятинам, на которые была разделена новгородская земля. Названия пятин были связаны с названиями местностей: Бежецкая, Деревская, Обонежская, Шелонская и Вотская. В каждую из пятин посылались писцы, которые составляли писцовые книги с подробными описаниями крестьянских и помещичьих хозяйств. Новгородские писцовые книги содержат много сведений о сельском хозяйстве и общем экономическом состоянии новгородских земель после присоединения их к Московскому государству, в них впервые были перечислены почти все населенные пункты того времени.
Большие изменения произошли и в мануфактурной промышленности. Вотчинные и посессионные мануфактуры постепенно приходили в упадок из-за низкой производительности подневольного труда. Мелкие и средние вотчинные мануфактуры разорялись. Сохранялись за счет дешевизны труда лишь самые крупные. К 1860 г. в обрабатывающей промышленности на вотчинных мануфактурах было занято лишь 11% рабочих.
Разложение коснулось и посессионной мануфактуры. Численность посессионных работников постоянно падала. Особенно резко она сократилась в 40-х-50-х гг., когда правительство удовлетворило ходатайства владельцев заводов о разрешении увольнять посессионных работников.
В то же время продолжался рост купеческих и крестьянских мануфактур, основанных на вольнонаемном труде. Особенно успешно вольнонаемный труд внедрялся в хлопчатобумажной промышленности, где по найму трудилось свыше 90% рабочих.
В 30-х гг. XIX в. в России начался промышленный переворот, т.е. переход от ручного труда к машинному, от мануфактуры - к фабрике.
Развитие российской промышленности было неравномерным по отраслям и по районам. Полотняная промышленность переживала упадок из-за преобладания подневольного крепостного труда и падения спроса на парусное полотно из-за перехода английского флота на паровые двигатели. Значительно быстрее развивались хлопчатобумажная, суконная, металлообрабатывающая промышленность. Правда, развитие металлообработки сдерживалось отставанием металлургии, сосредоточенной на Урале и основанной на подневольном труде и устаревшей технике.
Крупнейшими центрами текстильного производства являлись Московская и Владимирская губернии, металлообработка развивалась в Петербургском районе.
Промышленный переворот в России сдерживался слабым развитием кредита (создание частных кредитных банков запрещалось, а казенные банки кредитовали, в первую очередь, дворян под залог имений), практическим отсутствием рынка свободной рабочей силы.
